协同创新是介于封闭式创新和开放式创新之间的更复杂的技术创新模式。从交易成本理论、资源基础理论、动态能力理论、知识经济等经济学分析来看，协同创新具有其独特优势，并且在推动重大技术进步方面的作用越来越突出。以协同创新为视角构建区域创新体系，是推动我国创新驱动发展战略实施的有效途径。在体系构建中，企业发挥主导性作用，各创新主体形成系统性效用，建立以知识增值、孵化新技术为目标的利益风险共同体，实现区域内外多层级体系开放互动。政府要进一步理清与市场的关系，实施普惠式和后补助式的支持政策，扶持或建立创新平台与孵化器，并打造多层级的知识产权保护制度。